A Pró-Reitoria de Ensino da URI – PROEn - é o órgão que superintende, orienta, planeja, coordena, dirige e fiscaliza todas as atividades de Ensino de Graduação, Seqüenciais, Superiores de Tecnologia – presenciais e a distância – e das Escolas de Educação Básica da Universidade. (Art. 28 – Estatuto).
Estão sob a responsabilidade da PROEN, dentre outras: a elaboração de políticas e diretrizes do ensino de Graduação, Seqüenciais, Superiores de Tecnologia e Escolas de Educação Básica; a coordenação dos processos de criação, implantação e reconhecimento de Cursos; os processos de seleção e ingresso de alunos; a coordenação do processo de avaliação dos Cursos de Graduação e da Educação Básica; a coordenação das atividades de registro e controle acadêmicos; a elaboração de Catálogos de Cursos, Calendário Acadêmico, Programas de Ensino, Manual Acadêmico; a elaboração de Normas Complementares ao Regimento Geral sobre processos seletivos, currículos e programas, matrículas, transferências, aproveitamento de estudos, verificações do rendimento escolar, estágios....